Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms