Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
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