Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ1Q96JM4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
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