Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RTP4Q96DX8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms