Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms