Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms