Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 IGF1R-210ENST00000559925 2280 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 32.4
TBRG4Q969Z0 YWHAE-213ENST00000576854 1374 nt22.22■■□□□ 1.152e-8■■■■■ 32.4
TBRG4Q969Z0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 32.4
TBRG4Q969Z0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.4
TBRG4Q969Z0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.4
TBRG4Q969Z0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 32.4
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TBRG4Q969Z0 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 32.4
TBRG4Q969Z0 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 32.4
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TBRG4Q969Z0 NASP-225ENST00000629893 253 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 32.4
TBRG4Q969Z0 YWHAE-205ENST00000489287 465 ntTSL 211.16□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 32.4
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TBRG4Q969Z0 YWHAE-211ENST00000573196 739 ntTSL 210.44□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 32.4
TBRG4Q969Z0 YWHAE-207ENST00000498643 312 ntTSL 310.02□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 32.4
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TBRG4Q969Z0 YWHAE-203ENST00000469398 676 ntTSL 28.75□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 32.4
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TBRG4Q969Z0 EVL-205ENST00000553771 560 ntTSL 47.65□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 32.3
TBRG4Q969Z0 SOX13-209ENST00000534185 723 ntTSL 522.99■■□□□ 1.276e-7■■■■■ 32.3
TBRG4Q969Z0 SOX13-208ENST00000530882 769 ntTSL 321.49■■□□□ 1.036e-7■■■■■ 32.3
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TBRG4Q969Z0 SOX13-202ENST00000367203 3525 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 32.3
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TBRG4Q969Z0 CACNA2D4-205ENST00000536846 895 ntTSL 514.78□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 32.3
TBRG4Q969Z0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 32.3
TBRG4Q969Z0 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 214.47□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 32.3
TBRG4Q969Z0 CACNA2D4-207ENST00000537923 556 ntTSL 412.58□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 32.3
TBRG4Q969Z0 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 32.3
TBRG4Q969Z0 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 32.3
TBRG4Q969Z0 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.424e-7■■■■■ 32.3
TBRG4Q969Z0 CACNA2D4-206ENST00000537784 2876 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 32.3
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TBRG4Q969Z0 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 32.3
TBRG4Q969Z0 CACNA2D4-203ENST00000444595 4450 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 32.3
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TBRG4Q969Z0 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 520.84■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 32.2
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TBRG4Q969Z0 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 32.2
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TBRG4Q969Z0 ARID1B-231ENST00000637887 1468 ntTSL 55.13□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 32.2
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TBRG4Q969Z0 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 32.2
TBRG4Q969Z0 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 516.75■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 32.2
TBRG4Q969Z0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 32.2
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TBRG4Q969Z0 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.288e-12■■■■■ 32.1
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TBRG4Q969Z0 CLK3-206ENST00000562078 2455 ntTSL 213□□□□□ -0.337e-11■■■■■ 32
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TBRG4Q969Z0 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.477e-11■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.587e-11■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.597e-11■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.67e-11■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 TBCK-218ENST00000511011 560 ntTSL 410.8□□□□□ -0.682e-20■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-291ENST00000626440 461 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-329ENST00000628455 361 ntTSL 510.55□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 CLK3-226ENST00000569406 3591 ntTSL 210.54□□□□□ -0.727e-11■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 TSPAN9-202ENST00000407263 956 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 32
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TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-335ENST00000628883 891 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-290ENST00000626370 784 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-339ENST00000629184 731 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-328ENST00000628374 766 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-310ENST00000627181 1099 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-313ENST00000627327 1257 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
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TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-353ENST00000629836 723 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-320ENST00000627918 1146 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-304ENST00000626898 961 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-350ENST00000629603 874 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
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