Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms