Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMTQ93088 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms