Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3BQ92485 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms