Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY2Q8WXA3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY2Q8WXA3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms