Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms