Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf40Q8WUR7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms