Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHST4Q8NCG5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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