Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms