Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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