Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTOP1Q7RTM1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms