Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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