Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC9Q6ZRR7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC9Q6ZRR7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms