Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms