Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms