Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms