Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms