Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms