Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SAMD13Q5VXD3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SAMD13Q5VXD3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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SAMD13Q5VXD3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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