Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms