Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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