Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC158Q5M9N0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms