Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms