Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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