Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms