Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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