Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR2Q16832 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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