Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME3Q16798 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME3Q16798 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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