Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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E2F4Q16254 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
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