Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SNCBQ16143 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SNCBQ16143 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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