Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ZNF56Q15929 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF56Q15929 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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