Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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