Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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