Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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