Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBFBQ13951 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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