Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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DNASE1L3Q13609 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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DNASE1L3Q13609 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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DNASE1L3Q13609 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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DNASE1L3Q13609 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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DNASE1L3Q13609 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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DNASE1L3Q13609 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms