Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NAE1Q13564 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms