Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms