Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRQ13535 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRQ13535 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms