Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
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