Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCGB2A2Q13296 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms