Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms