Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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