Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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